Qua thanh tra tại các dự án phát triển mạng lưới cấp 1, 2 tiếp nhận nước dự án cấp nước Kênh Đông; dự án xây dựng hệ thống cấp nước sạch cho huyện Cần Giờ; dự án sửa chữa, phục hồi tuyến ống nước thô D1800 Hoá An - Thủ Đức, đoàn thanh tra phát hiện nhiều sai sót trong công tác lập, thẩm định, phê duyệt dự toán. Điển hình là sai khối lượng bột clo, đóng cọc thép, vải địa; sai so với biện pháp thi công; sai số học; sai hệ số điều chỉnh nhân công; sai cấp đất đóng cọc và một số nguyên nhân khác dẫn đến làm tăng giá trị gói thầu hơn 13,5 tỷ đồng tại các dự án được thanh tra.
Đoàn thanh tra cũng phát hiện một số tồn tại trong công tác lựa chọn nhà thầu như hồ sơ mời thầu không yêu cầu về quy phạm thi công, nghiệm thu; tổ chuyên gia xét thầu không yêu cầu nhà thầu bổ sung bảng biểu theo hồ sơ; thẩm định kết quả đấu thầu vượt quá thời gian theo quy định.
Không những vậy, còn phê duyệt kết quả đấu thầu trước khi có quyết định phê duyệt bổ sung nhà thầu đạt yêu cầu kỹ thuật.
Trong công tác quản lý chất lượng công trình cũng tồn tại một số vấn đề như thực hiện chưa đúng các quy định về quản lý chất lượng thi công công trình: Không có biên bản nghiệm thu một số công việc; không kiểm tra điều kiện năng lực hoạt động xây dựng của các nhà thầu khảo sát xây dựng so với hồ sơ dự thầu; không có hồ sơ quản lý chất lượng cho phần biện pháp thi công; thi công khi chưa nghiệm thu một số loại vật liệu, không thiết kế cấp phối mác bê tông 150, 200, 250; thiếu chứng chỉ xuất xưởng của một số loại vật liệu; nhật ký thi công nội dung ghi không cụ thể, chi tiết; một số trang thiếu chữ ký của đơn vị tư vấn giám sát...
Trong công tác nghiệm thu, thanh quyết toán đã thanh toán không đúng khối lượng thực tế, lập hồ sơ thanh toán sai tăng tổng số tiền hơn 3,36 tỷ đồng tại các dự án thanh tra.
Thanh tra Bộ Xây dựng đề nghị TCty Cấp nước Sài Gòn chấn chỉnh, rút kinh nghiệm trong công tác quản lý các dự án đầu tư công trình; kiểm điểm trách nhiệm tập thể, cá nhân có liên quan đến vi phạm. Các nhà thầu tham gia thực hiện các dự án cần nghiêm túc kiểm điểm những sai sót và chấn chỉnh trong công tác quản lý chất lượng, thực hiện đúng các quy định của Nhà nước về quản lý chất lượng công trình xây dựng.
Đồng thời, yêu cầu TCty Cấp nước Sài Gòn giảm trừ khi quyết toán đối với các công trình với tổng số tiền hơn 2 tỷ đồng; thu hồi gần 1,3 tỷ đồng tiền đã nghiệm thu thanh toán sai của các nhà thầu được chỉ ra qua thanh tra.